Az Erdőrezervátum Programot az Agrárminisztrérium Erdőgazdálkodási Főosztálya támogatja, valamint a HUN-REN ÖK Ökológiai és Botanikai Intézete (korábban MTA ÖBKI). Finanszírozást nyújt továbbá a HUN-REN Magyar Kutatási Hálózat (korábban: Eötvös Loránd Kutatási Hálózat) közcélú monitorozási programja. Korábban a programot a természetvédelmi tárca (KöM/KTM/KvVM Természetvédelmi Hivatala, majd VM/FM ...), és egyes nemzeti park igazgatóságok támogatták.
Egyetemeink és doktori iskoláink részéről jelentős az egyetemi és doktorandusz hallgatók témavezetése, valamint a gyakornokok közreműködése.